Resulta que en un equipo, el menú “Aplicaciones” no mostraba su contenido. Los menúes “Lugares” y “Sistema” funcionaban correctamente mostrando su contenido.
Luego de buscar un rato encontré que para restaurar el menú de aplicaciones de gnome a su contenido original, lo que hay que hacer es eliminar el archivo:
/home/usuario/.config/menus/applications.menu ó copiarlo desde otro equipo…
en mi caso particular, el archivo estaba en tamaño 0 bytes, probablemente por algún problema de red con los homes compartidos por NFS.